國家稅務總局 國稅發(fā)[2003]121號 國家稅務總局關于加強貨物運輸業(yè)稅收征收管理的通知

國家稅務總局 國家稅務總局關于加強貨物運輸業(yè)稅收征收管理的通知
國稅發(fā)[2003]121號

狀態(tài)：部分失效廢止

   
   附件二《運輸發(fā)票增值稅抵扣管理試行辦法》第二條第二款第（一）項"（固定資產除外）"作廢

各省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市國家稅務局、地方稅務局：
為了進一步貫徹國務院關于整頓市場經濟秩序的決定，加強對貨物運輸業(yè)的稅收管理，總局制定了《貨物運輸業(yè)營業(yè)稅征收管理試行辦法》、《運費發(fā)票增值稅抵扣管理試行辦法》、《貨物運輸業(yè)營業(yè)稅納稅人認定和年審試行辦法》和《貨物運輸業(yè)發(fā)票管理流程實施方案》（以下簡稱“三個辦法和一個方案”），現印發(fā)給你們，請你們按照以下要求認真貫徹執(zhí)行。
一、執(zhí)行“三個辦法和一個方案”是整頓稅收秩序、推進依法治稅、加強營業(yè)稅征收管理、規(guī)范增值稅抵扣的重大舉措。各級稅務部門的領導要高度重視，統(tǒng)一思想，加強對此項工作的領導。
二、各級稅務機關接到通知后要認真學習“三個辦法和一個方案”的內容，研究貫徹執(zhí)行的具體操作辦法。具體工作方案由各省稅務機關部署，各級稅務機關要從全局的利益出發(fā)，認真負責，相互配合，通力協作，按照各自工作范圍積極穩(wěn)妥地貫徹落實“三個辦法和一個方案”，全面做好加強貨物運輸業(yè)稅收征收管理的各項工作。凡相互推諉，不執(zhí)行“三個辦法和一個方案”或執(zhí)行不到位的，一律按規(guī)定追究相關單位和有關人員的責任。
三、各地接到本通知后，要召開專門會議，布置此項工作，做好宣傳工作，加強對有關稅務人員和納稅人的培訓，要按照“三個辦法和一個方案”的要求結合本地實際制定相關配套措施，保證將“三個辦法和一個方案”執(zhí)行到位。
四、各地要將本地區(qū)貫徹落實情況于2003年12月31日前書面報告總局（5份），總局將對各地執(zhí)行本通知情況進行通報。
（請各地速向下轉發(fā)）
附件：1.貨物運輸業(yè)營業(yè)稅征收管理試行辦法
2.運輸發(fā)票增值稅抵扣管理試行辦法
3.貨物運輸業(yè)營業(yè)稅納稅人認定和年審試行辦法
4.貨物運輸發(fā)票管理流程實施方案

貨物運輸業(yè)營業(yè)稅納稅人認定和年審試行辦法

第一條 根據國家稅務總局《貨物運輸業(yè)營業(yè)稅征收管理試行辦法》的規(guī)定，對公路、內河貨物運輸業(yè)自開票、代開票納稅人（以下簡稱自開票、代開票納稅人）實行認定和年審制度，特制定本辦法。
第二條 提供公路、內河貨物運輸勞務（以下簡稱貨物運輸勞務）的單位需申請自開票納稅人的，應向主管地方稅務局辦理認定手續(xù)。
第三條 提供貨物運輸勞務的單位同時符合下列條件的，可向其主管地方稅務局申請認定為自開票納稅人：
（一）具有工商行政管理部門核發(fā)的營業(yè)執(zhí)照，地方稅務局核發(fā)的稅務登記證，交通管理部門核發(fā)的道路運輸經營許可證、水路運輸許可證；
（二）年提供貨物運輸勞務金額在20萬元以上（新辦企業(yè)除外）；
（三）具有固定的經營場所。如是租用辦公場所，則承租期必須1年以上；
（四）在銀行開設結算賬戶；
（五）具有自備運輸工具，并提供貨物運輸勞務；
（六）賬簿設置齊全，能按發(fā)票管理辦法規(guī)定妥善保管、使用發(fā)票及其他單證等資料，能按稅務機關和財務會計制度的要求正確核算營業(yè)收入、營業(yè)成本、稅金和營業(yè)利潤，并能按規(guī)定向稅務機關進行納稅申報和繳納各項稅款。
第四條 以下納稅人不能認定為自開票納稅人：（一）不同時具備本辦法第三條規(guī)定條件的單位；（二）不同時具備以下條件的承包人、承租人以及掛靠人（屬代開票人，其“雙定”稅款可由主管稅務機關委托出包方、出租方以及掛靠方統(tǒng)一代征）；
1.以出包方、出租方、被掛靠方的名義對外經營，由出包方、出租方、被掛靠方承擔相關的法律責任；
2.經營收支全部納入出包方、出租方、被掛靠方的財務會計核算；
3.利益分配以出包方、出租方、被掛靠方的利潤為基礎。
（三）擁有運輸工具的個人。
第五條 申請辦理自開票納稅人認定的單位，應提供或出示下列有關證件和資料：
（一）單位申請報告；
（二）貨物運輸業(yè)自開票納稅人認定表；
（三）營業(yè)執(zhí)照復印件；
（四）稅務登記證副本；
（五）車輛道路運輸證、船舶營業(yè)運輸證復印件；
（六）自有房屋產權證或房屋租賃合同復印件；
（七）購置自有運輸工具購買發(fā)票復印件；
（八）地方稅務局要求提供的其他有關證件、資料。
第六條 申請辦理自開票納稅人認定手續(xù)的程序（一）對現有的提供貨物運輸勞務的單位，應按以下程序辦理認定手續(xù)：
1.申請程序。提供貨物運輸勞務的單位應向主管地方稅務局提交申請報告，如實填寫《貨物運輸業(yè)自開票納稅人認定表》及認定所需資料。
2.審批程序和審批機關。自開票納稅人由縣級或縣級以上稅務機關認定。對單位提出的申請報告和有關資料，負責審批的稅務機關應在收到之日起30日內審核完畢。對符合自開票納稅人條件的，發(fā)給《貨物運輸業(yè)營業(yè)稅自開票納稅人認定證書》，并在其稅務登記證副本首頁上方和《發(fā)票領購簿》上加蓋“自開票納稅人”確認專用章，作為領購貨物運輸發(fā)票的證件。
（二）對新辦提供公路、內河貨物運輸勞務的單位新辦的提供貨物運輸勞務的單位，凡符合自開票納稅人條件，注冊資金在30萬元以上的，可在辦理稅務登記的同時申請辦理自開票納稅人認定手續(xù)。
新辦提供貨物運輸勞務的單位申請人，辦理自開票納稅人認定手續(xù)的程序，按本辦法第六條第一款規(guī)定辦理。
第七條 除自開票納稅人以外的其他提供貨物運輸勞務的單位和個人，同時符合下列條件的，可向其主管地方稅務局申請認定代開票納稅人：（一）有工商行政管理部門核發(fā)的營業(yè)執(zhí)照，地稅局核發(fā)的稅務登記證；（二）有自備或承包、承租的車、船等運輸工具的證明。
第八條 單位和個人申請辦理代開票納稅人認定手續(xù)，應提供下列有關證件和資料：（一）單位和個人申請報告；（二）貨物運輸業(yè)代開票納稅人認定表；（三）營業(yè)執(zhí)照復印件；（四）稅務登記證復印件；（五）車輛道路運輸證、船舶營業(yè)運輸證復印件；（六）承包、承租或掛靠車輛應提供出包、出承租或所掛靠方的稅務登記證復印件、納稅人識別碼及承包、承租或掛靠合同復印件；（七）地方稅務局要求提供的其他有關證件、資料。
第九條 申請辦理代開票納稅人認定手續(xù)的程序（一）對現有提供貨物運輸勞務的單位和個人，應按以下程序辦理認定手續(xù)。
1.申請程序單位和個人應提交申請報告，如實填寫《貨物運輸業(yè)代開票納稅人認定表》及地方稅務局要求提供的其他資料。
2.審批程序和審批機關代開票納稅人認定的審批權限在縣級或縣級以上地方稅務局。對單位和個人提出的申請報告和有關資料，負責審批的地方稅務局應在收到之日起30日內審核完畢。符合代開票納稅人條件的，發(fā)給《貨物運輸業(yè)營業(yè)稅代開票納稅人認定證書》。納稅人憑《貨物運輸業(yè)營業(yè)稅代開票納稅人認定證書》及同貨主簽定的承運貨物合同、托運單及地方稅務局要求提供的其他有效證明到代開票單位代開貨物運輸業(yè)發(fā)票。
（二）對新辦提供貨物運輸勞務的單位和個人新辦提供貨物運輸勞務的單位和個人需認定為代開票納稅人的，凡符合代開票納稅人條件的，可在辦理稅務登記的同時申請辦理代開票納稅人認定手續(xù)。
第十條 代開票納稅人達到自開票納稅人條件的，可以按本辦法第六條第一款規(guī)定申請辦理自開票納稅人認定手續(xù)。
第十一條 地方稅務局應按年度對自開票、代開票納稅人進行資格審驗和確認。
第十二條 年審的范圍地方稅務局應對原已認定為自開票、代開票納稅人實行年度審驗制度（以下簡稱年審）。
第十三條 年審的時間自開票、代開票納稅人的年審從每年11月起至12月底結束，具體期限由省級地方稅務局確定。
第十四條 年審的內容（一）自開票納稅人1.基本情況。包括納稅人名稱、經營地址、經濟性質、經營范圍、開戶銀行及賬號、車輛、船舶等運輸工具狀況、聯系電話等。
2.納稅情況。包括本年度實現的營業(yè)額、營業(yè)成本、應納稅額、實繳稅額和欠繳稅額等。
3.財務核算情況。包括會計人員配備、賬簿設置、財務核算狀況等。
4.貨物運輸發(fā)票管理情況。包括貨物運輸業(yè)發(fā)票領購、使用、結存、保管、繳銷及違章情況。
（二）代開票納稅人1.基本情況。包括納稅人名稱、經營地址、經濟性質、經營范圍、開戶銀行及賬號、車輛、船舶等運輸工具狀況、聯系電話等。
2.納稅情況。包括年審本年度實現的營業(yè)額、營業(yè)成本、應納稅額、實繳稅額和欠繳稅額等。
第十五條 年審的程序（一）按照年審規(guī)定的時間要求，自開票、代開票納稅人應到主管地方稅務局領取《自開票、代開票納稅人年審申請審核表》（以下簡稱《年審表》），填寫蓋章后連同工商營業(yè)執(zhí)照副本、道路、水上運輸經營許可證復印件、稅務登記證副本、《發(fā)票領購簿》、年度財務報表及稅務機關要求提供的其他資料，一并報主管地方稅務局。
（二）主管地稅局接到自開票、代開票納稅人申報的《年審表》及有關資料后30日內進行初審，并簽署初審意見，逐級報送上級審批機關，審批機關應在30日內作出年審結論。年審審批機關是指有批準認定自開票、代開票納稅人資格的縣級或縣級以上的地方稅務局。
第十六條 年審的結果（一）自開票納稅人1.年審合格的處理對年審合格的自開票納稅人，在《貨物運輸業(yè)營業(yè)稅自開票納稅人認定證書》及《發(fā)票領購簿》上加貼自開票納稅人年審合格標識。
2.年審不合格的處理達不到自開票納稅人資格的納稅人，暫緩通過年審，在3個月內進行整改，整改期間不得自行開具貨物運輸業(yè)發(fā)票，如需開具貨物運輸業(yè)發(fā)票的由主管地方稅務局代開。在規(guī)定的期限內，整改合格的按年審合格辦法處理，整改不合格的取消其自開票納稅人資格，清繳貨物運輸發(fā)票，并在其稅務登記證副本首頁右上方和《發(fā)票領購簿》上加蓋“已取消自開票納稅人資格”專用章，并收回《貨物運輸業(yè)營業(yè)稅自開票納稅人認定證書》。
（二）代開票納稅人1.年審合格的處理對年審合格的代開票納稅人，在《貨物運輸業(yè)營業(yè)稅代開票納稅人認定證書》上加貼代開票納稅人年審合格標識。
2.年審不合格的處理達不到代開票納稅人資格的納稅人，暫緩通過年審，在3個月內進行整改，整改期間主管地方稅務局不得為其開具貨物運輸業(yè)發(fā)票。在規(guī)定的期限內，整改合格的按年審合格的辦法處理，整改不合格取消其代開票納稅人的資格，并收回《貨物運輸業(yè)營業(yè)稅代開票納稅人認定證書》。
第十七條 對已具有自開票納稅人資格的提供貨物運輸勞務單位，一旦發(fā)現有下列情形之一的，經主管地方稅務局審定，可取消其自開票納稅人的資格，收回《貨物運輸業(yè)營業(yè)稅自開票納稅人認定證書》和停止其使用貨物運輸業(yè)發(fā)票。
（一）沒有按地方稅務局的要求正確核算貨物運輸和非貨物運輸的營業(yè)收入、營業(yè)成本、稅金、營業(yè)利潤的；
（二）不能按規(guī)定向稅務機關進行正常納稅申報和繳納各項稅款的；
（三）有偷稅、抗稅行為的；
（四）不能妥善保管、使用貨物運輸業(yè)發(fā)票造成嚴重后果的；
（五）違反規(guī)定，對貨物運輸和非貨物運輸業(yè)務都開具貨物運輸業(yè)發(fā)票的；
（六）違反規(guī)定，為其他納稅人開具貨物運輸業(yè)發(fā)票的。
第十八條 對已具有代開票納稅人資格提供貨物運輸勞務的單位和個人，凡有下列情形之一的，經主管地方稅務局審定，可取消其代開票納稅人的資格，并收回《貨物運輸業(yè)營業(yè)稅代開票納稅人認定證書》。
（一）沒有按地方稅務局的要求準確核算貨物運輸和非貨物運輸的營業(yè)收入、稅金的；
（二）不按規(guī)定向稅務機關進行納稅申報和繳納各項稅款的；
（三）有偷稅、抗稅行為的；
（四）有偽造承運貨物合同等有效證明的。
第十九條 納稅人必須在規(guī)定的期限內向地方稅務局辦理年審手續(xù)，在規(guī)定期限內未辦理年審手續(xù)的按年審不合格處理。
第二十條 《年審表》填報不實、數據不準確的，隨同《年審表》報送其他資料不齊全，以及其他未按規(guī)定辦理年審手續(xù)的，地方稅務局應責令其在年審規(guī)定期內如實申報和補報。如仍不如實申報和補報的，則按年審不合格處理。
第二十一條 凡被取消自開票、代開票納稅人資格的納稅人，一年內不得再重新申請認定自開票、代開票納稅人。
第二十二條自開票、代開票納稅人年審，由省級地方稅務局統(tǒng)一組織，年審的具體工作，由具有批準認定自開票納稅人資格的各級地方稅務局負責實施。
第二十三條 《貨物運輸業(yè)自開票納稅人認定表》、《貨物運輸業(yè)代開票納稅人認定表》、《貨物運輸業(yè)營業(yè)稅自開票納稅人認定證書》、《貨物運輸業(yè)營業(yè)稅代開票納稅人認定證書》、《年審表》、年審合格標識、“自開票納稅人”、“已取消自開票納稅人資格”專用章由省級地方稅務局統(tǒng)一制定下發(fā)。
第二十四條 本辦法由國家稅務總局負責解釋。
第二十五條 本辦法自2003年11月1日起實行。
運輸發(fā)票增值稅抵扣管理試行辦法

第一條 為了進一步加強增值稅有關運輸發(fā)票抵扣憑證的管理，堵塞稅收漏洞，特制定本辦法。
第二條 凡增值稅一般納稅人（以下簡稱“納稅人”）取得運輸發(fā)票并應計算抵扣進項稅額的，均適用本辦法。
本條所稱取得運輸發(fā)票是指：（一）納稅人外購貨物（固定資產除外 加粗字作廢）支付運輸費用而取得的運費結算單據；（二）納稅人銷售應稅貨物而支付運輸費用所取得的運費結算單據（《中華人民共和國增值稅暫行條例實施細則》第十二條所規(guī)定的不并入銷售額的代墊運費除外）。
第三條 運輸單位提供運輸勞務自行開具的運輸發(fā)票，運輸單位主管地方稅務局及省級地方稅務局委托的代開發(fā)票中介機構為運輸單位和個人代開的運輸發(fā)票準予抵扣。其他單位代運輸單位和個人開具的運輸發(fā)票一律不得抵扣。
第四條 納稅人取得所有需計算抵扣增值稅進項稅額的運輸發(fā)票，應根據相關運輸發(fā)票逐票填寫《增值稅運輸發(fā)票抵扣清單》（見本辦法附件），在進行增值稅納稅申報時，除按現行規(guī)定申報報表資料外，增加報送《增值稅運輸發(fā)票抵扣清單》。納稅人除報送清單紙質資料外，還需同時報送《增值稅運輸發(fā)票抵扣清單》的電子信息。未單獨報送《增值稅運輸發(fā)票抵扣清單》紙質資料及電子信息的，其運輸發(fā)票進項稅額不得抵扣。如果納稅人未按規(guī)定要求填寫《增值稅運輸發(fā)票抵扣清單》或者填寫內容不全的，該張運輸發(fā)票不得計算抵扣進項稅額。
增值稅運輸發(fā)票抵扣清單信息采集軟件由國家稅務總局統(tǒng)一開發(fā)，主管國稅局免費提供給納稅人。如果納稅人無使用信息采集軟件的條件，可委托中介機構代為采集。
第五條 納稅人取得的2003年10月31日以后開具的運輸發(fā)票，應當自開票之日起90天內向主管國稅局申報抵扣，超過90天的不得予以抵扣。納稅人取得的2003年10月31日以前開具的運輸發(fā)票，必須在2004年1月31日前抵扣完畢，逾期不再準予抵扣。 （此條廢止）
第六條 主管國稅局在納稅申報期內受理申報時，應對《增值稅納稅申報表附列資料（表二）》中第8欄“7％扣除率”的“金額、稅額”項數據與《增值稅運輸發(fā)票抵扣清單》中“合計”欄“允許計算抵扣的運費金額、計算抵扣的進項稅額”項數據進行核對，如不一致，退納稅人重新申報。
第七條 納稅申報期結束后，各地縣（市）級國稅局應將當期《增值稅運輸發(fā)票抵扣清單》匯總電子信息通過網絡傳遞給上級稅務機關。
運輸發(fā)票信息的采集、傳遞、清分與比對等具體要求詳見《貨物運輸發(fā)票管理流程實施方案》。
第八條 對比對不符的先由稽查部門進行稽查，經查實后確有問題的按有關規(guī)定進行處理?；椴块T應將稽查、處理結果及時反饋管理部門。
第九條 運輸發(fā)票增值稅抵扣管理試行辦法
貨物運輸業(yè)營業(yè)稅征收管理試行辦法

第一條 為了進一步貫徹國務院關于整頓市場經濟秩序的決定，加強對貨物運輸業(yè)營業(yè)稅的征收管理，根據《中華人民共和國稅收征收管理法》及其實施細則、《中華人民共和國營業(yè)稅暫行條例》及其實施細則、《中華人民共和國發(fā)票管理辦法》以及其他相關的法律、法規(guī)的規(guī)定，特制定本辦法。
第二條 在中華人民共和國境內提供公路、內河貨物運輸勞務（以下簡稱貨物運輸勞務）的單位和個人均適用本辦法。
第三條 在中華人民共和國境內提供貨物運輸勞務的單位和個人，屬于“交通運輸業(yè)”營業(yè)稅納稅義務人。
以上所稱個人，是指個體工商戶及其他有經營行為的個人。
實行承包、承租、掛靠方式提供貨物運輸勞務凡同時具備以下條件的，以出包方、出租方、被掛靠方為營業(yè)稅納稅義務人；不同時具備以下條件的，以承包人、承租人、掛靠人為營業(yè)稅納稅義務人（以下簡稱“承包人”、“承租人”、“掛靠人”）：（一）以出包方、出租方、被掛靠方的名義對外經營，由出包方、出租方、被掛靠方承擔相關的法律責任；（二）經營收支全部納入出包方、出租方、被掛靠方的財務會計核算；（三）利益分配以出包方、出租方、被掛靠方的利潤為基礎。 （此條廢止）
第四條 提供貨物運輸勞務的單位和個人，根據其開具貨物運輸業(yè)發(fā)票的方式，分為自開票納稅人和代開票納稅人。
自開票納稅人，是指符合規(guī)定條件，向主管地方稅務局申請領購并自行開具貨物運輸業(yè)發(fā)票的納稅人。
自開票納稅人不包括個人、承包人、承租人以及掛靠人。
代開票納稅人，是指除自開票納稅人以外的需由代開票單位代開貨物運輸業(yè)發(fā)票的單位和個人。
以上所稱代開票單位是指主管地方稅務局。
經省級地方稅務局批準也可以委托中介機構代開貨物運輸業(yè)發(fā)票。
第五條 第四條所稱符合規(guī)定條件，是指同時具備以下條件：
（一）具有工商行政管理部門核發(fā)的營業(yè)執(zhí)照，地方稅務局核發(fā)的稅務登記證。交通管理部門核發(fā)的道路運輸經營許可證、水路運輸許可證；（二）年提供貨物運輸勞務金額在20萬元以上（新辦企業(yè)除外）；（三）具有固定的辦公場所。如是租用辦公場所，則租期必須1年以上；（四）在銀行開設結算賬戶；（五）具有自備運輸工具，并提供貨物運輸勞務；（六）賬簿設置齊全，能按發(fā)票管理辦法規(guī)定妥善保管、使用發(fā)票及其他單證等資料，能按財務會計制度和稅務局的要求正確核算營業(yè)收入、營業(yè)成本、稅金、營業(yè)利潤并能按規(guī)定向主管地方稅務局正常進行納稅申報和繳納各項稅款。
第六條 自開票納稅人應按照發(fā)票管理辦法及相關的法律、法規(guī)的規(guī)定，如實填開貨物運輸業(yè)發(fā)票，加蓋財務印章和開票人專章（見附件一）。
自開票納稅人對下列情況不得開具貨物運輸業(yè)發(fā)票：（一）未提供貨物運輸勞務；（二）非貨物運輸勞務；（三）由其他納稅人（包括承包人、承租人及掛靠人）提供的貨物運輸勞務。
第七條 代開票納稅人提供貨物運輸勞務，凡需開具貨物運輸業(yè)發(fā)票的，提供以下資料并繳納稅款后，由代開票單位代開貨物運輸業(yè)發(fā)票： （此條廢止）
（一）《代開票納稅人資格認定證書》；（二）所承運貨物同貨主簽訂的承運貨物合同或其他有效證明。
代開票單位為承包人、承租人以及掛靠人代開發(fā)票時，統(tǒng)一使用出包方、出租方以及被掛靠方的單位名稱和納稅人識別號。
代開票單位對代開的貨物運輸業(yè)發(fā)票應按發(fā)票所注承運單位逐戶建立貨物運輸收入臺賬，逐筆登記代開發(fā)票數量、發(fā)票號碼、開具金額，并將代征的稅款按法律、法規(guī)的規(guī)定及時解繳入庫。
第八條 除自開票納稅人和代開票單位以外，其他任何單位和個人均不得開具貨物運輸業(yè)發(fā)票。
第九條 貨物運輸業(yè)必須使用全國統(tǒng)一的發(fā)票，發(fā)票的樣式和內容由國家稅務總局另行制定。
鐵路運輸、航空運輸、海洋運輸的貨物運輸業(yè)發(fā)票應按照國家稅務總局統(tǒng)一規(guī)定的格式、內容印制和使用。
第十條 自開票納稅人和代開票單位必須按照規(guī)定逐欄、如實填開貨物運輸業(yè)發(fā)票。凡開具給增值稅一般納稅人的貨物運輸業(yè)發(fā)票，必須填寫該增值稅一般納稅人的名稱和納稅人識別號。
第十一條 貨物運輸業(yè)發(fā)票的印制、領購、開具、取得、保管、繳銷均由地方稅務局管理和監(jiān)督。凡已經委托給其他部門管理的，必須依法收回。
第十二條 在全國實行新的由稅控器具開具貨物運輸業(yè)發(fā)票以前，貨物運輸業(yè)發(fā)票清單匯總、傳遞方法如下：（一）地方稅務局代開貨物運輸業(yè)發(fā)票時要先征收稅款后再開具貨物運輸業(yè)發(fā)票，并將代開的貨物運輸業(yè)發(fā)票填寫《地稅局代開貨物運輸業(yè)發(fā)票清單》（見附件二）。
自開票納稅人在申報繳納營業(yè)稅時，除報送營業(yè)稅申報表外，必須向主管地方稅務局報送《自開票納稅人貨物運輸業(yè)發(fā)票清單》（見附件三）的紙制文件和電子信息。
納稅人每月申報繳納營業(yè)稅的計稅營業(yè)額，不得小于每月發(fā)票開具金額。
代開票中介機構代開貨物運輸業(yè)發(fā)票時要先代征稅款后再開具貨物運輸業(yè)發(fā)票。代開票中介機構在解繳代征稅款后，必須按主管地方稅務局規(guī)定的申報期限向主管地方稅務局報送《中介機構代開貨物運輸業(yè)發(fā)票清單》（見附件四）的紙制文件和電子信息。
（二）《地稅局代開貨物運輸業(yè)發(fā)票清單》、《自開票納稅人貨物運輸業(yè)發(fā)票清單》和《中介機構代開貨物運輸業(yè)發(fā)票清單》必須是電子信息，軟件由國家稅務總局統(tǒng)一制作（見《貨物運輸業(yè)發(fā)票管理流程實施方案》）。
（三）縣（市）級地方稅務局應將《地稅局代開貨物運輸業(yè)發(fā)票清單》和《自開票納稅人貨物運輸業(yè)發(fā)票清單》、《中介機構代開貨物運輸業(yè)發(fā)票清單》進行匯總，并將匯總后的電子信息于每月20日前送同級國家稅務局。
凡具備網絡條件的地方稅務局，可由縣（市）級地方稅務局將《地稅局代開貨物運輸業(yè)發(fā)票清單》、《自開票納稅人貨物運輸業(yè)發(fā)票清單》、《中介機構代開貨物運輸業(yè)發(fā)票清單》匯總后的電子信息上報地（市）或省級地方稅務局，由地（市）或省級地方稅務局將本級匯總后的電子信息于每月22日前送同級國家稅務局。
第十三條 對自開票納稅人實行查賬征收方法。對自開票納稅人開具的貨物運輸業(yè)發(fā)票注明的運費和其他價外收費，一律按“交通運輸業(yè)”稅目征收營業(yè)稅。
第十四條 對自開票納稅人的聯運業(yè)務，以其向貨主收取的運費及其他價外收費減去付給其他聯運合作方運費后的余額為營業(yè)額計算征收營業(yè)稅。
  以上所稱聯運必須同時符合以下條件：（一）自開票納稅人必須參與該項貨物運輸業(yè)務；（二）聯運合作方向自開票納稅人開具貨物運輸業(yè)發(fā)票；（三）自開票納稅人必須將其接受的貨物運輸業(yè)發(fā)票作為原始計賬憑證，妥善保管，以備稅務機關檢查。 （此條廢止）
第十五條 對代開票納稅人實行定期定額征收方法。代開票單位代開發(fā)票時，按代開的貨物運輸業(yè)發(fā)票注明的運費和其他價外收費即時征收營業(yè)稅、所得稅及附加，年終時對“雙定”戶按以下方法進行清算：（一）開票金額大于定額的，以開票金額數為依據征收稅款，并作為下一年度核定定期定額的依據。如定期定額稅款已征，可將按期征收的定期定額稅款退還納稅人或抵頂下期稅款；（二）開票金額小于定額的，按定額數征收稅款。如定期定額稅款已征，可將代開發(fā)票時征收的稅款數額退還納稅人或抵頂下期稅款。
第十六條 代開票納稅人是承包人、承租人以及掛靠人的，其“雙定”稅款可由主管地稅局委托出包方、出租方以及掛靠方統(tǒng)一代征。年終以出包方、出租方以及掛靠方為單位進行統(tǒng)一清算，清算及下一年度核定方法按本辦法第十五條的規(guī)定執(zhí)行。
第十七條 符合營業(yè)稅法規(guī)規(guī)定的減免條件的自開票納稅人，應向主管地方稅務局報送有關資料，并經主管地方稅務局認定后才能享受減免營業(yè)稅優(yōu)惠。
符合營業(yè)稅法規(guī)規(guī)定減免條件的代開票納稅人，必須提供主管地方稅務局批準的減免稅文書，其由代開票單位代開的貨物運輸業(yè)發(fā)票的營業(yè)額，才能享受減免營業(yè)稅優(yōu)惠。
省級地方稅務局要制定加強對營業(yè)稅減稅免稅的管理辦法。
第十八條 提供貨物運輸勞務的單位向其機構所在地主管地方稅務局申報繳納營業(yè)稅。
第十九條 提供貨物運輸勞務的承包人、承租人或掛靠人，向其發(fā)包、出租或所掛靠單位機構所在地主管地方稅務局申報繳納營業(yè)稅。
除本條第一款規(guī)定者外，其他提供貨物運輸勞務的個人向其運營車輛的車籍所在地主管地方稅務局申報繳納營業(yè)稅。
第二十條 凡委托中介機構代開貨物運輸業(yè)發(fā)票的，省級地方稅務局要制定對中介機構的管理辦法，保證稅款及時足額入庫。
第二十一條 地方稅務局要按規(guī)定向委托代征稅款單位支付代征稅款手續(xù)費。
第二十二條 提供貨物運輸勞務的單位和個人應向主管地方稅務局申請認定為自開票納稅人或代開票納稅人，并實行年審。具體認定和年審辦法由國家稅務總局另行制定。
第二十三條 自開票納稅人、代開票納稅人和代開票單位應嚴格執(zhí)行本辦法和其他相關法律、法規(guī)的有關規(guī)定，違者按照有關規(guī)定處理。
第二十四條 本辦法由國家稅務總局負責解釋。
第二十五條 本辦法自2003年11月1日起執(zhí)行。