根據(jù)《國家稅務總局非居民企業(yè)繳納企業(yè)所得稅有關問題的公告》（國家稅務總局公告2013年第9號）規(guī)定，營改增試點中的非居民企業(yè)，取得《企業(yè)所得稅法》第三條第三款規(guī)定的所得，在計算繳納企業(yè)所得稅時，應以不含增值稅的收入全額作為應納稅所得額。
對外支付計算初看相當復雜，不僅涉及營改增業(yè)務，還涉及企業(yè)所得源泉扣繳業(yè)務，甚至還涉及稅收協(xié)定待遇。
舉例：非居民企業(yè)與境內某公司簽訂特許權使用費合同，合同價款為100萬元人民幣，增值稅適用稅率為6%，預提企業(yè)所得稅稅率10%。
舉例計算時數(shù)字只精確到小數(shù)點后兩位，扣繳稅款只考慮增值稅、所得稅。我們實際業(yè)務操作時，應精確到人民幣分。
我們分為三種情況分析、計算：
一、合同價款100萬元，為增值稅含稅價，增值稅、所得稅由非居民企業(yè)承擔。
應納稅所得額＝增值稅不含稅銷售額＝100/（1+6%）=94.34萬元
應納所得稅額＝94.34*10%＝9.43萬元
增值稅＝100/（1+6%）*6%＝5.66萬元
對外支付金額＝100-9.43-5.66＝84.91萬元
二、常見的合同，約定稅后支付100萬元，增值稅、所得稅由支付方承擔。
那么設合同價款為含稅價X萬元，則X-增值稅-所得稅＝100萬元
X-X/（1+6%）*6%- X/（1+6%）*10%＝100萬元
X＝100*（1+6%）/（1-10%）＝117.78萬元
應納稅所得額＝增值稅不含稅銷售額＝100/（1-10%）＝111.11萬元
增值稅＝100/（1-10%）*6%＝6.67萬元
所得稅＝100/（1-10%）*10%＝11.11萬元
對外支付金額＝100萬元
三、如果非居民企業(yè)在支付方主管稅務機關進行稅收協(xié)定待遇備案，享受協(xié)定待遇。
假定非居民企業(yè)是香港居民企業(yè)，稅后支付100萬元。
（一）如果是普通特許權使用費，協(xié)定優(yōu)惠稅率7%
應納稅所得額＝增值稅不含稅銷售額＝100/（1-7%）＝107.53萬元
增值稅＝100/（1-7%）*6%＝6.45萬元
所得稅＝100/（1-7%）*7%＝7.53萬元
（二）如果是對飛機和船舶租賃業(yè)務支付的特許權使用費，協(xié)定優(yōu)惠稅率5%
應納稅所得額＝增值稅不含稅銷售額＝100/（1-5%）＝105.26萬元
增值稅＝100/（1-5%）*6%＝6.32萬元
所得稅＝100/（1-5%）*5%＝5.26萬元
由于實際對外支付中，一般合同金額遠遠超過增值稅起征點和小微企業(yè)免征額，所以免征增值稅的情形不再討論。